林奈迷人、高傲，而且十分确定他将改变自然学家们对生物的认知。从1735年出版的第一版薄薄的《自然系统》(Systema Naturae)开始，他就把动物和植物按照相似性进行了他眼中的自然分类。
他把动物分成了六大类：四足动物(带毛的)，鸟类(有羽毛的)，两栖类(两栖动物和爬行动物)，鱼类，昆虫和害虫(其他的一切)。他的同伴都觉得这么分类没什么不妥。但植物呢?
在解释林奈的植物分类方法之前首先需要解释一下，我们日常所说的植物名称并不是它真正的“学名”。以大家很熟悉的“朝天椒”为例，它的学名其实是Capsicum annuum var. conoides……下面我们就来介绍这种奇葩命名法是怎么逐渐演化出来的。
林奈决定通过解剖植物的花将它们分类。这听起来似乎很草率，但如果你知道花是植物的性器官，也许就不会这么觉得了。
林奈根据花中雄性部分——雄蕊的解剖情况，把植物分成了24类。每一大类又根据花中雌蕊的数目进一步分成小类。如果给它们起一些很无聊的名字，这种分类方法也就没什么吸引人的地方了。但林奈决定让一切变得值得纪念。植物名称的前半部分仅仅告诉自然学家雄蕊的数量，而后半部分则使用拉丁语中的“丈夫”一词。同样的，雌蕊的名字由数量和拉丁语的“妻子”一词组成。
如此一来，对于所有使用林奈分类法学习的人来说，一种叫做Triandria Monogynia的植物，感觉像是“三个丈夫分享一个妻子”。有些与林奈同时代的人并不具有这种幽默感，他们把这种命名方式称作“令人憎恨的卖淫行为”(loathsome harlotry)并把林奈称作“植物学的色情作品作者”(botanical pornographer)。但那时候这已经是最好的分类系统了，所以成为被广泛接受的植物组织方法。
此后20年间，林奈让他的学生去环游世界并带回新的动植物给他命名，修订并扩充了《自然系统》。到1753年，他为物种命名发展出了一套二名法(two-name convention)去代替复杂又难记的拉丁语描述。所以西红柿(tomato)的名字由Solanum caule inermi herbaceo, foliis pinnatis incisis, racemis simplicibus (是的，这一长串只是一个名字，意思是：有草状光滑茎秆的番茄科属，拥有切刻的羽状树叶)变成了更加简明的 Solanum lycopersicum。
到现在，我们依然在使用林奈发明的二名法。对于中国人来说，学植物学真是需要莫大的勇气啊。
