公开信息显示，现年57岁的高小燕是山西石楼人。1974年，17岁的高小燕因体育特长被兰州军区47军特招入伍。
1984年，高小燕调入位于西安的解放军第四军医大学，历任学员队副队长、直属党委办公室主任兼政治部办公室主任、大学团委副书记。
12年后，高小燕随丈夫调入京城，成为总后后勤科学研究所政治部干事，后相继任政治部主任，司令部政治协理员、司令部党委委员。
2005年底，高小燕出任解放军总医院第三〇九医院政委。2009年6月，原为解放军总医院(即三〇一医院)附属医院的三〇九医院整体转隶总参，高小燕除继续担任三〇九医院政委，同时还是总参管理保障部党委委员。2012年，高小燕调往郑州，担任解放军信息工程大学副政委、纪委书记，并从大校晋升为少将，成为为数不多的女将军。
据《解放军文艺》报道，高小燕担任三〇九医院政委期间，“干劲冲天，大事忙完一桩又一桩”。文章披露，医院建设了15栋工作人员宿舍楼，建成的三万平方米可停靠一千辆车的大型地下车库，系全国医院车库之最。还新盖干部医疗保健大楼、结核病研究所大楼，改扩建了门急诊大楼。
高小燕曾于2008年当选北京市第十三届人大代表;2012年9月当选中国领导科学研究会常务理事。担任《领导干部创新社会管理的理论与实践》大型文集特约编委。
据官方公布的简历，高小燕为国防大学政工硕士研究生。网络检索显示，其曾在《人民日报》《解放军报》《红旗文稿》等报刊上发表过不少政工文章，如《带头践行当代革命军人核心价值观》《工作要有激情》《创新发展先进军事文化的着力点》《领导干部的官德修为》等。
